分子和原子的区别在于化学反应中可再分，构成分子中的原子重新组合成新物质的分子在化学反应中不可再分，化学反应前后并没有变成其它原子。
相似点：
(1)都是构成物质的基本粒子;
(2)质量、体积都非常小，彼此间均有一定间隔，处于永恒的运动中;
(3)同种分子(或原子)性质相同，不同种分子(或原子)性质不同;
(4)都具有种类和数量的含义。
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